Características Morfológicas: Inicialmente, os organismos recém-descobertos são classificados com base em suas características morfológicas, como características físicas, estruturas e aparência geral. Os cientistas examinam vários aspectos como tamanho, forma, coloração, estrutura corporal, apêndices e características únicas. A classificação morfológica serve como uma etapa preliminar na compreensão das características gerais do organismo e na identificação de semelhanças com espécies conhecidas.

Análise molecular: Os avanços na biologia molecular tornaram o sequenciamento de DNA uma ferramenta vital na taxonomia moderna. Os cientistas extraem DNA do organismo e analisam seu material genético. Ao comparar sequências de DNA com aquelas de organismos conhecidos, eles podem determinar o parentesco genético e as relações evolutivas. A análise de DNA permite uma classificação mais precisa e ajuda a identificar novas espécies, mesmo que tenham morfologias semelhantes.

Análise Bioquímica: Características bioquímicas, como a presença de proteínas específicas, enzimas ou outros marcadores bioquímicos, também podem ser utilizadas para classificação. Esses marcadores podem fornecer informações sobre o metabolismo, a fisiologia e a composição genética do organismo. A análise bioquímica complementa os dados morfológicos e moleculares, oferecendo uma compreensão abrangente das características biológicas do organismo.

Dados ecológicos e comportamentais: Informações sobre o habitat do organismo, interações ecológicas, comportamento e ciclo de vida podem contribuir para sua classificação. Estudar onde vive um organismo, suas interações com outras espécies e seus comportamentos únicos pode revelar pistas importantes sobre sua história evolutiva e relações com outros organismos.

Evidência paleontológica: No caso de organismos extintos, os dados paleontológicos, como os registos fósseis, podem fornecer informações valiosas para a classificação. Ao examinar restos fossilizados, os cientistas podem obter insights sobre a morfologia, anatomia e relações evolutivas do organismo, ajudando a colocá-lo no contexto mais amplo da Árvore da Vida.

É importante observar que os sistemas de classificação são dinâmicos e estão em constante evolução à medida que novas informações e descobertas são feitas. Os cientistas utilizam uma combinação destes critérios e integram várias linhas de evidência para atribuir um organismo recém-descoberto ao grupo taxonómico mais apropriado e determinar as suas relações evolutivas com as espécies existentes.