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    Os genomas individuais dos pacientes podem afetar a eficácia, segurança da edição de genes
    p A parte superior deste diagrama mostra uma região de 30 pares de bases de um único locus genético (HLA-A) que está envolvida na resposta imune e pode ser potencialmente alvo de edição de gene. As seis barras menores abaixo dela representam diferentes RNAs-guia que são projetados para se ligar a diferentes partes desse locus HLA-A. No eixo Y (vertical) estão haplótipos com variações de DNA destacadas identificadas de diferentes indivíduos. Eles são alinhados de acordo com suas posições na sequência genética (representados horizontalmente no eixo X). Crédito:Lessard S; et al. PNAS Early Edition , semana de 11 de dezembro, 2017

    p A edição de genes começou a ser testada em ensaios clínicos, usando CRISPR-Cas9 e outras tecnologias para editar diretamente o DNA dentro das células das pessoas, e vários estudos estão recrutando ou em fase de planejamento. Um novo estudo liderado pelo Hospital Infantil de Boston e pela Universidade de Montreal levanta uma nota de cautela, descobrir que diferenças genéticas de pessoa para pessoa podem prejudicar a eficácia do processo de edição de genes ou, em casos mais raros, causar um efeito potencialmente perigoso "fora do alvo". p O estudo adiciona evidências de que a edição de genes pode precisar ser adaptada ao genoma de cada paciente, para garantir que não existam variantes na sequência de DNA no ou próximo ao gene que está sendo direcionado, o que poderia prejudicar a tecnologia. As descobertas aparecem esta semana no Proceedings of the National Academy of Sciences (11 a 15 de dezembro).

    p "Os humanos variam em suas sequências de DNA, e o que é tomado como a sequência de DNA "normal" para referência não pode ser responsável por todas essas diferenças, "diz Stuart Orkin, MD, do Dana-Farber Boston Children's Cancer and Blood Disorders Center e co-autor do estudo com Matthew Canver, um estudante de MD-PhD na Harvard Medical School. "Recomendamos que a variação comum seja levada em consideração na concepção de sistemas de direcionamento para edição terapêutica, para maximizar a eficácia e minimizar potenciais problemas de segurança. "

    p O estudo analisou 7, 444 sequências de genoma completo publicadas anteriormente. Com base em uma lista de cerca de 30 alvos de DNA relacionados a doenças que os pesquisadores estão interessados ​​em alterar por meio da edição de genes, os pesquisadores fizeram uma segunda lista de quase 3, 000 RNAs guia (gRNAs). Estes são pedaços de código genético que foram desenvolvidos para direcionar as enzimas CRISPR-Cas9 para o local de edição correto ou adjacente ao alvo, como o endereço em um envelope.

    p O time, liderado por Orkin, Canver e Samuel Lessard, da Universidade de Montreal, então olhei para ver se algum dos 7, 444 indivíduos carregavam variantes de sequência de DNA ("alterações de letras" ou inserções / deleções) nas áreas que os gRNAs procuram.

    p "Se houver diferenças genéticas no local que os reagentes CRISPR têm como alvo para a terapia, você está em risco de diminuição da eficácia ou falha do tratamento, "explica Canver, que concebeu e liderou o estudo no laboratório do Hospital Infantil de Orkin em Boston. "Uma diferença em apenas um único par de bases pode causar uma diminuição na eficiência de ligação devido a uma incompatibilidade com o RNA guia. isso pode causar uma redução na eficácia do tratamento. "

    p A equipe descobriu que tais ocorrências no genoma não são incomuns; cerca de 50 por cento dos gRNAs analisados ​​tinham o potencial de ser afetados por variantes em seus locais-alvo. Em alguns casos, a equipe encontrou variantes genéticas que fazem com que as sequências de DNA no genoma correspondam mais de perto a um gRNA que poderia potencialmente atraí-lo para o lugar errado - resultando em uma edição de um gene ou outra região do DNA que não deveria ser direcionada.

    p "Em casos raros, havia o potencial de criar locais 'fora do alvo' muito potentes - onde os reagentes CRISPR poderiam se ligar e cortar onde não deveriam, "diz Canver." Se um efeito fora do alvo acontecer, dizer, um gene supressor de tumor, isso seria uma grande preocupação. "

    p Embora o estudo tenha analisado a edição do gene CRISPR-Cas9, os pesquisadores acreditam que suas descobertas se estendem a outras ferramentas de edição de genes, como nucleases de dedo de zinco (ZFN) e nucleases efetoras de TAL.

    p "O tema unificador é que todas essas tecnologias dependem da identificação de trechos de bases de DNA muito especificamente, "diz Canver." Então, uma variante que afeta a sequência alvo pode reduzir a ligação do RNA guia. As variantes também podem levar à ligação em novos sites que podem causar danos. À medida que essas terapias de edição de genes continuam a se desenvolver e começam a se aproximar da clínica, é importante ter certeza de que cada terapia será adaptada ao paciente que será tratado. "


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