Os dois principais grupos de procariontes são:

* Bactérias : Estes são organismos unicelulares que carecem de um núcleo e outras organelas ligadas à membrana. Eles têm diversos metabolismos e são encontrados em quase todos os ambientes da Terra.
* Archaea: Estes também são organismos unicelulares sem núcleo e outras organelas ligadas à membrana. Eles são frequentemente encontrados em ambientes extremos (como fontes termais ou lagos muito salgados), mas também são encontrados em ambientes mais moderados.

Enquanto ambos os grupos são procariontes, os archaea são distintos das bactérias em sua genética, bioquímica e estrutura da parede celular. Eles estão mais intimamente relacionados aos eucariotos (como plantas e animais) do que de bactérias.