Quando você ouve sobre o microbioma intestinal, você já se perguntou quais pequenas criaturas estão fervilhando dentro do seu próprio corpo? Como microbiologista que estuda os microbiomas de plantas, animais e pessoas, observei o interesse público pelos micróbios intestinais crescer ao lado de pesquisas sobre sua possível influência dramática na saúde humana. Nos últimos anos, as técnicas de teste de microbioma usadas por pesquisadores como eu agora estão disponíveis para os consumidores em casa. Esses kits pessoais de teste de microbioma intestinal afirmam informar quais organismos vivem em seu intestino e como melhorar seu microbioma intestinal usando esses dados.
Fiquei muito interessado em como esses kits de teste caseiros funcionam, que tipo de informação eles fornecem e se eles podem realmente ajudá-lo a mudar seu microbioma intestinal. Então encomendei alguns kits da Viome, Biohm e Floré, experimentei e vasculhei meus próprios dados de microbioma. Aqui está o que eu aprendi.

Como funcionam os kits de microbioma intestinal?

Todos os kits de microbioma intestinal exigem que você colete cuidadosamente material fecal fresco. Você o coloca nos vários tubos fornecidos no kit e envia as amostras de volta para a empresa. Várias semanas depois, você receberá um relatório descrevendo os tipos de micróbios que vivem em seu intestino e sugestões sobre como mudar sua dieta ou atividades para alterar potencialmente seu microbioma intestinal.

O que os consumidores não sabem exatamente é como as empresas geram os dados do perfil microbiano de sua amostra fecal. Uma abordagem típica que eu e outros pesquisadores de microbioma usam é extrair e decodificar o material genético microbiano de uma amostra. Usamos esse material genético para identificar quais espécies de micróbios estão presentes. O desafio é que esse processo pode ser feito de muitas maneiras diferentes, e não há padrões amplamente aceitos para qual é o melhor método.

Por exemplo, análises de microbioma podem ser feitas em dois tipos de material genético, RNA ou DNA. Se o perfil for baseado em DNA, ele pode fornecer apenas um instantâneo de quais tipos de micróbios estão presentes, não quais genes microbianos estão ativos ou quais atividades eles estão realizando em seu corpo. Por outro lado, se o perfil for baseado em RNA, ele pode dizer não apenas quais micróbios estão presentes, mas também se eles estão desempenhando um papel na digestão ou produzindo metabólitos que podem reduzir a inflamação intestinal, entre outras funções. A Viome gera seus perfis analisando o RNA, enquanto as outras empresas usam o DNA.

Outras opções de análise de dados, como como os diferentes tipos de sequências genéticas são classificadas ou quais bancos de dados são usados ​​para identificar os micróbios, também podem afetar o nível de detalhe e a utilidade dos dados finais. Os cientistas de microbiomas geralmente são muito cuidadosos ao apontar essas nuances ao interpretar seus próprios dados em artigos científicos, mas esses detalhes não são apresentados claramente em kits de microbiomas domésticos.

O que aprendi sobre meu microbioma intestinal

Embora eu tenha usado a mesma amostra fecal para cada kit, bem misturado para garantir a uniformidade, fiquei surpreso que cada um dos três produtos que experimentei me deu impressões diferentes do meu microbioma intestinal.

Cada empresa dá uma "pontuação" geral sobre como seu microbioma se compara ao que eles consideram "bom" ou "saudável". Minhas pontuações variaram de 39% (não ótimo) a 72% (bom). Curiosamente, Viome, que infere atividade microbiana usando RNA, deu a pontuação mais baixa. Ele observou que certas atividades microbianas que acontecem no meu intestino, como a produção de metano e a eficiência da digestão, não eram ideais.

Também fiquei surpreso com a variação na diversidade microbiana total que cada empresa relatou. Embora houvesse um acordo geral nos grupos gerais de micróbios presentes no nível do filo, um agrupamento biológico mais geral, havia uma enorme variação no nível da espécie, o agrupamento mais específico. Uma empresa relatou 527 espécies de micróbios em meu microbioma, enquanto outra relatou 312. Uma relatou apenas 27.

Talvez a descoberta mais surpreendente foi que meu intestino pode abrigar um micróbio que poderia (há muitas ressalvas aqui!) representar um problema para mim no futuro se eu passar por certas situações médicas. Embora todas as empresas tenham procurado explicitamente esse micróbio na minha amostra de microbioma intestinal, apenas duas realmente o encontraram. Embora eu não vá nomear o micróbio exato para proteger a privacidade da minha saúde, não estou muito preocupado com esse resultado porque mais informações, como o sequenciamento completo do genoma do micróbio, são necessárias para entender melhor se essa é realmente uma cepa preocupante. micróbio. Mas essa descoberta aponta para uma variação surpreendente nos resultados em diferentes kits de teste.

Esses dados podem realmente melhorar seu microbioma intestinal?

Muitos cientistas de microbioma como eu provavelmente argumentariam que os dados que esses kits fornecem são limitados em termos de dar a você o poder de alterar sua saúde. Isso ocorre em parte porque a ciência do microbioma intestinal ainda é um campo novo com muitas perguntas sem resposta.

One challenge is that different people can have different proportions of microbes present in their gut. This variation has made it difficult for scientists and health professionals to agree on what type of microbial community makes a gut "healthy." Some specific species, such as the bacterium C. diff , and some broad groups, like Proteobacteria, are usually considered undesirable in high amounts. But there is no clear consensus on why one microbiome might be better than another.

Even if you did try to improve your gut microbiome based on what your gut test told you, the results might not turn out as you hoped. Probiotics or diet changes can alter the diversity of your gut microbiome and how it functions, but studies often find that each person can have different responses to these interventions, possibly because of their own unique microbiome composition. The personalized ecology of gut microbial communities, combined with genetics, diet and other factors, makes it challenging to prescribe universal solutions.

So why bother getting a gut microbiome test? For me, it was illuminating to learn what microbes I carry around with me each day. When I eat my lunch, go for a run or get stressed out, the microbes in my gut respond to changes in my body. Researchers may not completely understand what those changes mean and how to manage our microbial partners, but getting to know who they are is a great first step.