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    Usando redes para entender a regulação gênica específica de tecido
    p Pesquisadores do Brigham and Women's Hospital descobriram que diferentes funções do tecido surgem de uma maquinaria biológica central que é amplamente compartilhada entre os tecidos, em vez de seus próprios reguladores individuais. Em um artigo publicado em Relatórios de Célula , Kimberly Glass, PhD, da Divisão Channing de Medicina em Rede, e sua equipe explicam como eles usaram PANDA (Atributos de passagem entre redes para assimilação de dados) para criar modelos de rede das interações entre fatores de transcrição e genes, descobrir que a presença de diferentes funções do tecido é o resultado de sutis, mudanças específicas de tecido em uma rede regulatória. Para cada uma dessas funções específicas do tecido, a rede tem os mesmos componentes principais, mas eles são combinados de maneiras diferentes com informações genéticas e ambientais adicionais. A equipe analisou dados do consórcio Genotype-Tissue Expression (GTEx), entre outras fontes de informações regulatórias, reconstruir e caracterizar redes regulatórias para 38 tecidos. p PANDA, um modelo criado por Glass e sua equipe em 2013, foi qualificada exclusivamente para esta investigação porque pode modelar com mais precisão as interações entre os fatores de transcrição - que ajudam a controlar onde, quando e em que medida os genes são ativados - e seus alvos. Resumir as complexas interações entre fatores de transcrição e genes é um passo importante na compreensão dos padrões da rede que informam como a regulação gênica dá origem a uma variedade de funções específicas do tecido.

    p Os autores também observaram que a regulação da função específica do tecido é amplamente independente da expressão do fator de transcrição. Eles observam que existem aproximadamente 30, 000 genes no genoma humano, mas menos de 2, 000 deles codificam fatores de transcrição.

    p "Um grande número de processos deve ser realizado para que um tecido funcione adequadamente, "disse Glass." Em vez de ativar fatores de transcrição específicos para realizar esses vários processos, descobrimos que as redes que conectam esses reguladores a seus genes-alvo são reconfiguradas para coordenar de forma mais eficaz a ativação dessas funções do tecido. "

    p A equipe observa que seu trabalho destaca a importância de considerar o contexto de tecidos específicos ao desenvolver terapias medicamentosas. Dado que redes regulatórias alteradas governam funções diferentes, isso será importante para compreender os potenciais efeitos colaterais dos medicamentos fora do tecido-alvo.


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