Os dois domínios dos procariontes são:

1. bactérias: Esse domínio inclui a maioria dos procariontes com os quais estamos familiarizados, daqueles encontrados no solo e na água aos que vivem em ambientes extremos.
2. Archaea: Esse domínio consiste em organismos unicelulares que foram originalmente classificados como bactérias, mas agora são reconhecidos como distintos deles devido à sua bioquímica, genética e fisiologia única. Muitas arqueias prosperam em ambientes extremos, como fontes termais, lagos de sal e aberturas hidrotérmicas.