As duas substâncias principais que podem ser formadas na respiração anaeróbica são:

1. ácido lático: Isso é produzido em fermentação do ácido lático , que ocorre em animais (incluindo humanos) e algumas bactérias. É a razão da fadiga e dor musculares após exercícios intensos.
2. etanol (álcool): Isso é produzido em fermentação alcoólica , que ocorre em leveduras e algumas bactérias. É usado na produção de bebidas alcoólicas e pão.

Embora esses sejam os produtos mais comuns, outras substâncias podem ser formadas na respiração anaeróbica, dependendo do organismo e das condições específicas. Por exemplo, algumas bactérias podem produzir ácido butírico, ácido propiônico ou sulfeto de hidrogênio.