A forma de uma molécula de enzima pode ser afetada por vários fatores, internos e externos:

Fatores internos:

* sequência de aminoácidos: A estrutura primária de uma enzima, sua sequência de aminoácidos, determina sua forma tridimensional. Quaisquer alterações na sequência de aminoácidos, devido a mutações ou variações genéticas, podem alterar a estrutura da enzima e sua atividade.
* ligações dissulfeto: Essas ligações entre os resíduos de cisteína podem estabilizar a estrutura terciária de uma enzima. Alterações no número ou local das ligações dissulfeto podem afetar a forma da enzima.
* ligações de hidrogênio, interações iônicas, interações hidrofóbicas: Essas forças contribuem para o dobramento e a estabilidade da estrutura da proteína. A interrupção dessas interações pode alterar a forma da enzima.
* Modificações pós-traducionais: Modificações após a síntese proteica, como fosforilação ou glicosilação, podem influenciar a estrutura e a atividade da enzima.

Fatores externos:

* Temperatura: As enzimas têm uma faixa de temperatura ideal para atividade. As temperaturas extremas podem atrapalhar o delicado equilíbrio de interações que mantêm a enzima em sua forma ativa, levando à desnaturação (desdobramento) e perda de função.
* ph: Cada enzima tem uma faixa de pH ideal. O desvio dessa faixa pode atrapalhar as interações iônicas e as ligações de hidrogênio dentro da enzima, alterando sua estrutura e atividade.
* Concentração do substrato: Embora a presença de substrato não altere a forma da enzima, as altas concentrações de substrato podem saturar a enzima, causando uma mudança em sua forma geral.
* Inibidores: Inibidores competitivos se ligam ao local ativo de uma enzima, impedindo a ligação do substrato e alterando sua forma. Inibidores não competitivos se ligam a um local diferente na enzima, causando uma mudança conformacional que afeta o local ativo.
* ativadores: Algumas enzimas requerem cofatores (moléculas não proteínas) ou coenzimas (moléculas orgânicas) para funcionar. Essas moléculas podem se ligar à enzima e induzir uma mudança conformacional, permitindo a função adequada.
* desnaturantes: Esses agentes, como ácidos fortes, bases, detergentes ou metais pesados, atrapalham os laços fracos que mantêm a estrutura da enzima unida, levando à desnaturação.

É importante lembrar que a estrutura determina a função em enzimas. Qualquer alteração na forma da enzima pode afetar sua capacidade de se ligar ao seu substrato e catalisar a reação. Essa mudança de forma pode resultar em diminuição da atividade, inativação completa ou mesmo uma mudança na especificidade da enzima.