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Resistência a ácidos: A Salmonella desenvolveu mecanismos para resistir ao ambiente ácido do macrófago. Um mecanismo é a produção de um gene de resistência a ácidos (marA), que codifica um ativador transcricional que regula a expressão de outros genes envolvidos na resistência a ácidos, como o gene agfA, que codifica uma proteína da membrana externa que protege a bactéria do ácido.
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Bombas de efluxo: A Salmonella também pode usar bombas de efluxo para expelir prótons e outros íons nocivos da célula, mantendo assim um pH intracelular mais neutro.
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Sistemas de transdução de sinal de dois componentes: Salmonella possui sistemas de transdução de sinal de dois componentes que detectam e respondem a mudanças no ambiente externo, incluindo mudanças no pH. Esses sistemas podem ativar a expressão de genes envolvidos na resistência a ácidos, como o gene marA.
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Biofilmes: A Salmonella pode formar biofilmes, que são comunidades de bactérias aderidas a uma superfície. Os biofilmes podem proteger as bactérias da resposta imunológica do hospedeiro e proporcionar um ambiente mais favorável à sobrevivência.