A afirmação sobre a ausência de um sistema imunológico importante em muitas bactérias devido à autoimunidade não é precisa. A autoimunidade está normalmente associada ao sistema imunológico dos vertebrados e é caracterizada por uma resposta imune dirigida contra os próprios tecidos ou células do corpo. As bactérias não possuem um sistema imunológico adaptativo comparável ao dos vertebrados e não apresentam autoimunidade da mesma forma. As bactérias possuem vários mecanismos de defesa para se protegerem contra ameaças e infecções externas, que incluem barreiras físicas como a parede celular e a membrana, sistemas de modificação de restrição, sistemas CRISPR-Cas e outros mecanismos semelhantes ao sistema imunológico.