Os nidovírus expressam genes de forma redundante e codificam mais proteínas do que se acreditava anteriormente, achados de estudo
p Crédito:via Georgia State University
p Arterivírus, uma família de vírus de RNA de fita simples que pertence à ordem Nidovirales, produzem mais proteínas e RNAs mensageiros do que relatado anteriormente, uma descoberta que fornece informações importantes sobre um vírus que poderia evoluir para infectar humanos no futuro, de acordo com um novo estudo de pesquisa. p Anteriormente, apenas nove sequências de genoma, conhecidas como sequências regulatórias de transcrição (TRSs), foram relatados para o vírus da febre hemorrágica símia (SHFV), que infecta macacos. Contudo, o novo estudo usou tecnologia de sequenciamento de última geração e descobriu que 96 TRSs foram usados por este vírus para produzir RNAs mensageiros subgenômicos (mRNAs de sg) em células renais infectadas com SHFV e glóbulos brancos de macacos, macacos encontrados principalmente na Ásia. Quatro dos TRSs previamente identificados não foram os predominantes usados para a expressão gênica.
p Os resultados são publicados na revista
Proceedings of the National Academy of Sciences .
p "Este vírus atualmente não infecta chimpanzés ou humanos, mas é um dos vírus que recentemente foi colocado em uma lista de possíveis vírus emergentes que podem evoluir para infectar chimpanzés e / ou humanos no futuro, "disse a Dra. Margo A. Brinton, autor correspondente do artigo e Professor de Biologia da Regents 'na Georgia State University. "Ninguém entende o que está restringindo a gama de hospedeiros deste vírus com tanta precisão. O SHFV está no mesmo grupo de vírus que vários vírus que causam doenças agrícolas importantes e também está relacionado ao vírus SARS (Severe Acute Respiratory Syndrome)."
p A infecção por SHFV afeta macacos de diferentes espécies de maneiras diferentes. As infecções em espécies de macacos africanos são tipicamente assintomáticas, mas infecções em macacos asiáticos desencadeiam uma aguda, doença hemorrágica fatal com morte ocorrendo dentro de uma a duas semanas após a infecção. O vírus infecta macrófagos e células dendríticas, tipos de glóbulos brancos que são normalmente componentes essenciais da defesa inicial do hospedeiro contra uma infecção por vírus.
p Além do SHFV, a família dos arterivírus inclui o vírus da síndrome respiratória e reprodutiva suína (PRRSV), que causa doenças em porcos, e vírus da arterite equina (EAV), que causa doenças em cavalos.
p Nidovírus, o grande grupo de vírus ao qual pertencem os arterivírus, também incluem o Coronavirus, Famílias de mesonivírus e Ronivírus. Todos os nidovírus têm um mecanismo de replicação exclusivo para gerar mRNAs sg do lado direito do RNA do genoma, enquanto as poliproteínas replicativas virais são traduzidas diretamente do lado esquerdo do RNA do genoma.
p "Os TRSs regulam a produção dos modelos para os mRNAs sg do RNA do genoma, "Disse Brinton." A sabedoria era que havia um TRS primário para cada gene estrutural. Usando o sequenciamento de próxima geração para obter uma análise muito profunda de todos os mRNAs de sg que foram feitos nas células infectadas, descobrimos que havia vários TRSs para muitas das proteínas estruturais (um máximo de 11) e todos eles produziram mRNAs de sg. As pessoas pensaram que os poucos TRSs adicionais encontrados anteriormente eram apenas backups e não eram usados, a menos que o principal fosse desativado por mutação, mas nossos dados mostram que eles sempre são usados. "
p Os pesquisadores também descobriram TRSs na região esquerda do genoma que produzem mRNAs sg que fornecem um meio alternativo para o vírus amplificar a abundância de suas proteínas replicativas.
p Além disso, eles encontraram alguns TRSs que geraram mRNAs de sg com um quadro de leitura diferente do genoma, o que significa que proteínas previamente desconhecidas são produzidas. As sequências de nucleotídeos de RNA são lidas como tripletos por um ribossomo em tradução, com um aminoácido adicionado à proteína crescente por tripleto. O trigêmeo é chamado de quadro de leitura. Se for deslocado por um ou dois nucleotídeos, isso resulta em uma fase de leitura alternativa e uma sequência de aminoácidos diferente é traduzida.
p "Esta descoberta mostrou que o vírus pode realmente produzir mais proteínas do que se pensava anteriormente, "Brinton disse.
p O estudo também descobriu vários mRNAs de sg que produzem apenas o fragmento terminal de uma proteína viral conhecida.
p "Para testar a função de cada um desses fragmentos, "Brinton disse, "interrompemos sua produção nas células infectadas, uma de cada vez, alterando cada código de início para tradução. Menos vírus foi produzido quando dois desses fragmentos não foram produzidos, sugerindo que pelo menos algumas dessas pequenas proteínas são funcionalmente importantes.
p "As funções das proteínas virais recém-descobertas são desconhecidas. Ainda há muito mais que precisamos aprender para entender como essas proteínas virais manipulam a célula infectada e / ou regulam a replicação viral."