É um desafio distinguir com precisão entre Protoceratops masculinos e femininos apenas com base em características observáveis. Ao contrário de certas espécies onde o dimorfismo sexual é evidente em tamanho ou características físicas, os Protoceratops não apresentam diferenças externas óbvias entre os sexos. Portanto, pode ser difícil determinar o sexo do Protoceratops sem uma extensa análise científica.