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    Carne branca ou carne escura? Servindo big data para decifrar o jantar de Ação de Graças
    p Will Stone, Cat Hayes, e Duke Nguyen falam peru enquanto revisam os dados do espectrômetro de massa. Crédito:Virginia Tech

    p Para os formadores de bioquímica da Virginia Tech, Cat Hayes, Duque Nguyen, e Will Stone, o peru adquiriu um significado totalmente novo. p Os três, junto com seus colegas de bioquímica geral, foram desafiados por Richard Helm, professor associado do Departamento de Bioquímica da Faculdade de Agricultura e Ciências da Vida, para considerar a ciência por trás do Dia de Ação de Graças.

    p O professor deu a seus alunos a oportunidade de mergulhar no experimento, analisando grandes conjuntos de dados e passando um tempo no laboratório com instrumentos de última geração. Tomando o HokieBird como inspiração, os alunos realizaram uma análise de proteína de peru, olhando para a perna, coxa, e carne de peito. Eles foram convidados a investigar a diferença entre a carne branca e escura, analisando as proteínas que dão a cor ao peru.

    p "Você pode gastar muito tempo em conjuntos de dados, "disse Helm." Você pode obter mais perguntas do que respostas. Mas isso é algo que muitos alunos não são desafiados a fazer. Eu queria que eles examinassem dados reais de um experimento real em que tivessem a primeira chance de análise. "

    p Os alunos analisaram as proteínas mais essenciais, explorando identificações de proteínas de alta qualidade. Eles também aprenderam como localizar contaminantes nas amostras de peru para ver se o tecido estava limpo. A fim de entender a diferença numérica entre mama, coxa, e proteínas do tecido da perna, os alunos analisaram planilhas com milhares de campos - uma tarefa difícil. Eles então desenvolveram suas próprias fórmulas, codificação de cores, filtros, e outros métodos para permitir que eles vejam as diferenças e avaliem a significância estatística.

    p "Eu estava com medo e animado, "disse Stone, um junior de Springfield, Virgínia. "Depois de olhar para os dados do meu computador por pelo menos uma hora, Eu apenas pulei na água para descobrir como classificar tudo. "

    p Nguyen também usou um quadro branco para traçar as informações, junto com os diagramas de Venn.

    p Os testadores de perus também conseguiram ajuda de alta tecnologia, cortesia de um espectrômetro de massa acoplado a uma unidade de cromatografia líquida. Esta instrumentação recém-adquirida é capaz de realizar ensaios altamente sofisticados, mostrando aos jovens investigadores a abundância relativa de várias proteínas de peru. Embora os membros do Laboratório de Helm operassem a máquina, os alunos puderam aprender a ler os dados fornecidos pelo instrumento. A máquina também os ajudou a validar seus resultados.

    p Os pesquisadores descobriram que as enzimas envolvidas na glicólise, a via metabólica que converte glicose em energia, eram semelhantes na coxa e na perna do peru, e diferente no seio. As concentrações de proteínas da glicólise na mama foram maiores porque este músculo é usado para voar em pássaros, um processo que depende muito da glicólise.

    p A carne da coxa e da perna continha relativamente menos proteína glicólise e mais proteínas associadas às mitocôndrias porque esses tecidos recebem maiores níveis de oxigênio, e esses músculos são usados ​​com mais frequência quando o peru está em pé ou em movimento.

    p Embora seu foco fosse em proteínas, os alunos também analisaram os lipídios nos três tecidos de peru e descobriram que os lipídios da carne da coxa se oxidavam mais rápido do que a carne do peito ou da perna. Esse, de acordo com Helm, poderia impulsionar mais pesquisas de perus comparando congelados e frescos, selvagem versus doméstico, orgânico versus tradicional, e assim por diante.

    p "Foi muito divertido, "disse Hayes, um junior de Plainfield, Illinois. Todos os três alunos aprenderam que podem conquistar conjuntos de dados intimidantes, bem como aplicar seu conhecimento bioquímico a dados reais. Eles também estão ansiosos para ver que outras pesquisas podem ser inspiradas por seu trabalho.

    p Bem a tempo para o Dia de Ação de Graças, um subconjunto das descobertas dos alunos será publicado no BioRxiv, um arquivo online gratuito e serviço de distribuição de pré-impressões não publicadas nas ciências da vida.


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