O Estreito de Makassar, localizado entre Kalimantan (Bornéu indonésio) e Sulawesi, desempenha um papel crucial no fluxo indonésio (ITF) e na oceanografia regional. Liga os oceanos Pacífico e Índico e influencia significativamente as trocas de água entre as duas bacias. Embora a ITF seja reconhecida como o principal impulsionador da dinâmica do Estreito de Makassar, a variação da salinidade também contribui para a sua variabilidade sazonal. Aqui, analisamos os efeitos da salinidade na variabilidade sazonal do fluxo do Estreito de Makassar usando 25 anos de dados de reanálise oceânica e observações in situ. Nossos resultados mostram que o transporte de entrada no Estreito de Makassar está negativamente correlacionado com a salinidade da superfície do mar, sugerindo uma relação inversa entre a salinidade e a força do transporte. Além disso, as alterações na salinidade afectam o percurso da ITF através do Estreito de Makassar, influenciando a circulação superficial dentro do estreito. Além disso, sugerimos que os efeitos da salinidade poderiam desempenhar um papel fundamental na variabilidade interanual a decadal do fluxo do Estreito de Makassar, mas são necessárias investigações adicionais para verificar essas conexões.