A substituição mineral é um processo geológico onde um mineral é gradualmente dissolvido e substituído por outro mineral. Este processo geralmente ocorre em sistemas hidrotérmicos ou ambientes sedimentares, onde circulam fluidos ricos em minerais. Um exemplo comum de substituição mineral é a silicificação da madeira, onde o material orgânico da madeira é gradualmente substituído por sílica. A madeira silicificada resultante, também conhecida como madeira petrificada, mantém a sua estrutura e textura originais, mas é composta por quartzo ou outros minerais de sílica em vez de matéria orgânica. Outro exemplo notável de substituição mineral é a formação de pseudomorfos, onde um mineral ocupa o espaço originalmente ocupado por outro mineral, mantendo a forma e a forma do mineral original.