Os três estruturas unidas de um nucleotídeo são:

1. base nitrogenada: Esta é uma molécula contendo nitrogênio que vem em dois tipos principais:purinas (adenina e guanina) e pirimidinas (citosina, timina e uracil). A base específica determina a identidade do nucleotídeo.
2. açúcar: Este é um açúcar de cinco carbonos chamado desoxirribose no DNA e ribose em RNA. Forma a espinha dorsal do nucleotídeo.
3. grupo fosfato: Esta é uma molécula contendo fósforo e oxigênio, que é ligado ao açúcar. O grupo fosfato fornece ao nucleotídeo suas propriedades ácidas.

Esses três componentes estão ligados em uma ordem específica:o grupo fosfato é ligado ao carbono 5 'do açúcar e a base é ligada ao carbono 1' do açúcar.