Quando os aminoácidos são oxidados para formar energia celular, seus grupos amino são removidos e libertados como amônia (NH3) .

Aqui está um colapso do processo:

1. Deaminação: O primeiro passo no catabolismo de aminoácidos é a remoção do grupo amino. Esse processo é chamado de desaminação.
2. Produção de amônia: A desaminação libera a amônia (NH3) como um subproduto.
3. ciclo de uréia: A amônia é tóxica para o corpo, portanto deve ser convertida em uma forma menos tóxica. Essa conversão ocorre no fígado através do ciclo da uréia, onde a amônia é combinada com dióxido de carbono para formar a uréia (NH2) 2CO.
4. Excreção de uréia: A uréia é então excretada do corpo na urina.

Enquanto o grupo amino é o grupo primário removido e libertado como amônia, o esqueleto de carbono restante do aminoácido é ainda reduzido a energia através de várias vias metabólicas.