A estrutura redonda de coloração escura dentro do núcleo é conhecida como nucléolo . É o local da síntese do ribossomo, onde o RNA ribossômico (rRNA) é transcrito e processado e onde os ribossomos são montados. O nucléolo não é cercado por uma membrana e, em vez disso, é composto de moléculas de DNA, proteínas e RNA densamente compactadas. Muitas vezes é visível ao microscópio como uma estrutura esférica distinta dentro do núcleo.