Organismos que não realizam respiração incluem:
- Anaeróbios obrigatórios:esses organismos não conseguem sobreviver na presença de oxigênio e, portanto, não utilizam o oxigênio como aceptor final de elétrons na respiração celular. Em vez disso, eles usam aceitadores de elétrons alternativos, como sulfato, nitrato ou fumarato. Exemplos de anaeróbios obrigatórios incluem algumas bactérias e arquéias.

- Anaeróbios facultativos:estes organismos podem alternar entre respiração aeróbica (na presença de oxigênio) e respiração anaeróbica (na ausência de oxigênio) dependendo da disponibilidade de oxigênio. Quando o oxigênio está presente, eles usam a respiração aeróbica, mas quando os níveis de oxigênio caem, eles mudam para a respiração anaeróbica. Exemplos de anaeróbios facultativos incluem leveduras, algumas bactérias e alguns vermes parasitas.

- Anaeróbios aerotolerantes:estes organismos normalmente não crescem na presença de oxigénio, mas são capazes de sobreviver ou crescer na sua presença. No entanto, eles não usam oxigênio como aceptor terminal de elétrons na respiração; eles usam caminhos alternativos. Alguns anaeróbios aerotolerantes podem ter enzimas residuais para a respiração, mas estas enzimas não são ativas em condições aeróbicas. Os exemplos incluem algumas bactérias e fungos.

- Microaerófilos:estes organismos necessitam de uma baixa concentração de oxigénio para crescer e não toleram os elevados níveis de oxigénio presentes na atmosfera. Eles possuem enzimas especializadas e vias metabólicas que funcionam melhor com baixos níveis de oxigênio. Os exemplos incluem algumas bactérias e certas espécies de archaea.

- Archaea:enquanto algumas archaea realizam a respiração utilizando cadeias de transporte de electrões semelhantes às de outros organismos, outras utilizam mecanismos diferentes para gerar ATP. Por exemplo, algumas archaea empregam transportadores de elétrons alternativos, enquanto outras utilizam vias metabólicas únicas, como metanogênese ou acetogênese.