Dentro de uma partícula de vírus, o genoma é compactado e condensado para caber em um pequeno espaço. Este processo de condensação é essencial para que o vírus mantenha a sua integridade estrutural e proteja o seu material genético durante a transmissão entre hospedeiros. O mecanismo de condensação do genoma varia entre os diferentes tipos de vírus, mas algumas estratégias comuns incluem:
1.
Embalagem de DNA mediada por proteínas :
- Em alguns vírus de DNA, como bacteriófagos como o fago T4, o genoma é empacotado no capsídeo através da ação de proteínas especializadas. Essas proteínas, chamadas ATPases de empacotamento de DNA, ligam-se a sequências específicas de DNA e usam a energia da hidrólise do ATP para empurrar a molécula de DNA para o capsídeo.
2.
Spooling :
- O spooling é um mecanismo observado em alguns vírus RNA, como o HIV-1. Durante a montagem viral, o genoma do RNA é transcrito ativamente em uma longa molécula de RNA de fita simples. Esta molécula de RNA é então enrolada em uma estrutura cônica ou cilíndrica, guiada por proteínas do nucleocapsídeo. O RNA enrolado forma um núcleo compacto cercado pelo capsídeo viral.
3.
Enrolamento e empilhamento :
- Em alguns vírus, o genoma é empacotado através de uma combinação de interações de enrolamento e empilhamento. Por exemplo, nos herpesvírus, o genoma de DNA de fita dupla sofre enrolamento e forma uma estrutura toróide ou semelhante a um anel. Este DNA toroidal é ainda mais estabilizado por interações com proteínas virais, permitindo que o genoma se encaixe eficientemente no capsídeo.
4.
Estruturas semelhantes a nucleossomos :
- Alguns vírus de DNA, como os adenovírus, empacotam seu genoma em estruturas semelhantes a nucleossomos, que são complexos proteína-DNA encontrados em células eucarióticas. O DNA viral associa-se às histonas virais, formando partículas semelhantes a nucleossomos que condensam o genoma e o protegem da degradação.
5.
Glicoproteínas :
- As glicoproteínas presentes no envelope viral podem contribuir para a condensação do genoma em certos vírus. Ao interagir com o genoma viral, estas glicoproteínas ajudam a organizar e estabilizar o material genético dentro do virião.
6.
Coberturas e Conchas Proteicas :
- Em alguns vírus, como o rotavírus, uma camada proteica pode envolver o núcleo de ácido nucleico condensado. Este revestimento proteico é flexível e permite que o núcleo se condense e se expanda, garantindo a eficiência da replicação e transmissão viral.
7.
Transição de fase :
- Em certos vírus de RNA, como o vírus influenza A, os pesquisadores propuseram que o genoma sofre uma transição de fase do estado líquido para o gel durante a embalagem. Tal mudança de estado permite que o genoma adote um arranjo compacto e ordenado.
É importante notar que os mecanismos específicos de condensação do genoma podem variar dependendo da espécie viral, da estrutura do genoma e das vias de montagem. A capacidade dos vírus de empacotar eficientemente a sua informação genética dentro de um espaço confinado é crítica para a sua sobrevivência, replicação e transmissão em diferentes ambientes e hospedeiros.