Ao longo da evolução, as funções dos órgãos foram moldadas por vários fatores, incluindo:

Seleção natural: A seleção natural é o processo pelo qual os organismos mais bem adaptados ao seu ambiente têm maior probabilidade de sobreviver e se reproduzir. Isto significa que os órgãos essenciais para a sobrevivência e a reprodução têm maior probabilidade de serem preservados e transmitidos às gerações futuras. Por exemplo, o coração é essencial para bombear o sangue por todo o corpo, por isso é altamente conservado em todos os animais.

Deriva genética: A deriva genética é a mudança aleatória na frequência dos alelos em uma população. Isso pode levar à perda de certos genes e à evolução de novos genes. Por exemplo, a perda do gene da enzima lactase em algumas populações humanas levou à incapacidade de digerir a lactose, o açúcar encontrado no leite.

Restrições de desenvolvimento: As restrições de desenvolvimento são limitações na maneira como um organismo pode se desenvolver. Estas restrições podem ser causadas por vários factores, tais como a estrutura do corpo do organismo ou a disponibilidade de recursos. Por exemplo, o tamanho do coração de um animal é limitado pelo tamanho da cavidade torácica.

Adaptação: Adaptação é o processo pelo qual os organismos se tornam mais adaptados ao seu ambiente. Isso pode ocorrer por seleção natural, deriva genética ou restrições de desenvolvimento. Por exemplo, a evolução de pêlos mais grossos em animais que vivem em climas frios é uma adaptação que os ajuda a sobreviver em condições adversas.

Estes são apenas alguns dos fatores que moldaram as funções dos órgãos ao longo da evolução. O conjunto complexo e diversificado de órgãos que vemos hoje no mundo é o resultado de milhões de anos de mudanças evolutivas.