As bactérias possuem um genoma bem definido, que é o conjunto completo de moléculas de DNA que carregam a informação genética do organismo. As bactérias não possuem genes ocultos fora do seu genoma. No entanto, as bactérias podem adquirir novos genes através da transferência horizontal de genes, onde os genes são transferidos entre diferentes organismos, como através da absorção de ADN ou vírus estranhos.