Os antibióticos normalmente não são usados ​​para proteger as maçãs da praga do fogo. Em vez disso, podem ser utilizados bactericidas como estreptomicina ou oxitetraciclina. Existe o risco de que esses compostos destruam os micróbios do microbioma das árvores. No entanto, são necessárias mais pesquisas para compreender todo o impacto dos bactericidas no microbioma da maçã.