Revisão abrangente sobre os papéis significativos e mecanismos regulatórios dos lncRNAs em frutas e vegetais
Mecanismos reguladores de lncRNAs em frutas e vegetais. A lncRNAs regulam a expressão de genes na configuração cis ou trans. B Regulação mútua de lncRNAs e hormônios vegetais. Os C TFs ativam ou inibem a expressão de lncRNAs através do reconhecimento de locais de reconhecimento de transcrição dentro da região promotora de lncRNA; Os lncRNAs ligam-se a fatores de transcrição, formando complexos RNA-proteína que modulam a atividade dos fatores de transcrição. D No primeiro cenário, os lncRNAs atuam como precursores do miRNA. No segundo cenário, os miRNAs reconhecem e clivam os lncRNAs para gerar siRNA; Os lncRNAs estão ligados competitivamente aos miRNAs, regulando a expressão dos mRNAs alvo. E O splicing alternativo gera diversas variantes de lncRNAs; Os lncRNAs se ligam aos miRNAs, alterando a função reguladora dos miRNAs nos mRNAs e levando à produção de variantes distintas de mRNA. Crédito:Pesquisa em Horticultura (2024). DOI:10.1093/hr/uhae046 Com o desenvolvimento de tecnologias de sequenciamento do genoma, muitos RNAs não codificantes longos (lncRNAs) foram identificados em frutas e vegetais. Uma extensa pesquisa sobre lncRNAs revelou seu papel na regulação da expressão de genes codificadores de proteínas em níveis transcricionais e pós-transcricionais, desempenhando assim papéis cruciais no crescimento, desenvolvimento e respostas ao estresse em frutas e vegetais.
Uma nova revisão publicada em Horticulture Research fornece um resumo abrangente do entendimento atual da formação, características funcionais e mecanismos regulatórios de lncRNAs em frutas e vegetais.
Com base na direção e posição da transcrição em relação aos genes codificadores de proteínas, os lncRNAs são classificados em quatro tipos:lncRNAs intergênicos (lincRNAs), transcritos antisense longos não codificantes (lncNATs), lncRNAs de sentido e lncRNAs intrônicos (incRNAs). Neste artigo, a formação e as características básicas dos lncRNAs em frutas e vegetais são descritas a partir de três aspectos:abundância e tamanho, estrutura e localização, decadência e evolução.
Os papéis dos lncRNAs em frutas e vegetais foram resumidos e discutidos de forma abrangente em relatórios de pesquisa recentes, cobrindo vários aspectos, incluindo acúmulo de pigmentos, desenvolvimento de órgãos reprodutivos, amadurecimento de frutas, bem como respostas à deficiência de nutrientes, sal, seca, temperatura e bactérias patogênicas. .
Além disso, os autores elucidaram os mecanismos reguladores dos lncRNAs na regulação da transcrição gênica e no splicing alternativo, bem como as interações entre lncRNAs e hormônios vegetais, fatores de transcrição e miRNAs.
O desenvolvimento da tecnologia de sequenciamento de alto rendimento melhorou muito a capacidade de descobrir, prever e identificar lncRNAs. No entanto, permanece uma escassez de dados abrangentes de análise de lncRNA em bancos de dados de plantas relativos a lncRNAs em frutas e vegetais, dificultando a caracterização da expressão e localização do lncRNA.
Além disso, o custo associado aos experimentos de localização subcelular de lncRNAs, como o FISH, representa uma limitação nos estudos de lncRNAs, destacando a necessidade urgente do desenvolvimento de métodos mais acessíveis para a pesquisa de lncRNAs.
A exploração da função e do mecanismo dos lncRNAs nas culturas de frutas e vegetais ainda está em seus estágios iniciais, e o rápido desenvolvimento da tecnologia trará novas oportunidades e avanços para a pesquisa de lncRNA em frutas e vegetais.
