Título: Explorando a base molecular de como a pradimicina A se liga ao N-glicano viral, um potencial inibidor de entrada do SARS-CoV-2

Resumo:

A pandemia de COVID-19 em curso causada pelo vírus SARS-CoV-2 criou uma necessidade urgente de intervenções terapêuticas eficazes. A pradimicina A, um produto natural isolado de Streptomyces, demonstrou atividade antiviral promissora contra vários vírus envelopados, incluindo SARS-CoV-2, ao atingir o N-glicano viral. No entanto, os detalhes moleculares de como a pradimicina A interage com o N-glicano e inibe a entrada viral permanecem obscuros. Realizamos experimentos de acoplamento molecular, simulações de dinâmica molecular e ressonância plasmônica de superfície (SPR) para investigar a base molecular da ligação da pradimicina A ao N-glicano do SARS-CoV-2. Nossos resultados sugerem que a pradimicina A forma complexos estáveis ​​com o N-glicano através de ligações de hidrogênio, interações eletrostáticas e contatos hidrofóbicos. Em particular, as porções 2,6-diaminoglicose e 3,4,6-tri-hidroxifenil da pradimicina A desempenham papéis cruciais na ligação ao N-glicano. Além disso, os experimentos de SPR confirmaram a interação direta entre a pradimicina A e o N-glicano. No geral, nosso estudo fornece insights sobre os mecanismos moleculares subjacentes à atividade antiviral da pradimicina A e destaca seu potencial como composto líder para o desenvolvimento de novos inibidores de entrada do SARS-CoV-2.