Open Reading Frame (ORF) Uma estrutura de leitura aberta (ORF) é uma sequência de DNA ou RNA que pode ser traduzida em uma proteína. É caracterizado por:
1. Iniciar códon: Uma ORF começa com um códon inicial, normalmente agosto (metionina).
2. Código de parada: Uma ORF termina com um códon de parada, normalmente UAA, UAG ou UGA.
3. Sequência de codificação contínua: A sequência entre os códons de partida e parada é um trecho contínuo de códons que pode ser traduzido em uma proteína.
4. Quadro de leitura: ORFs são lidos em um quadro de leitura específico, o que significa que os códons estão agrupados em conjuntos de três nucleotídeos.
Significado de ORFs: * Síntese de proteínas: ORFs fornecem as informações genéticas necessárias para a síntese de proteínas.
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Identificação do gene: Identificar ORFs é uma etapa crucial na previsão e anotação de genes.
* ANÁLISE FUNCIONAL: A análise de ORFs pode ajudar a determinar a função dos genes.
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Estudos evolutivos: ORFs desempenham um papel na compreensão das relações evolutivas entre os organismos.
Encontrando ORFs: As ORFs são normalmente identificadas usando ferramentas bioinformáticas que pesquisam os seguintes recursos:
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Iniciar e parar os códons *
Comprimento da sequência de codificação *
Homologia de sequência para genes conhecidos Exemplo: `` `
... Atggtgcaaggttacgtgtag ...
`` `
Nesta sequência, a ORF é:
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Iniciar códon: AUG
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Pare o códon: Uag
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sequência de codificação: Atggtgcaaggttacgtgt
Nota: * Nem todos os ORFs são traduzidos em proteínas. Alguns ORFs podem não ser codificadores ou podem codificar para RNAs não codificadores de proteínas.
* O comprimento e a sequência de uma ORF podem variar amplamente entre os genes.
* O conceito de ORFs é essencial para entender a expressão gênica e a função proteica.
