A sequência de nucleotídeos em uma sonda de DNA determina sua especificidade. Aqui está o porquê:

* sondas de DNA funcionam por hibridação: Eles se ligam a seqüências complementares em uma molécula de DNA alvo.
* A especificidade vem do emparelhamento de bases: As quatro bases nucleotídicas (adenina, timina, guanina, citosina) são especificamente (A com T, G com C).
* sequências exclusivas: Cada sonda de DNA é projetada para ter uma sequência que corresponda a uma região única do DNA alvo.

Pense nisso como uma trava e chave:

* A sonda de DNA é a chave e o DNA alvo é a trava.
* A sequência específica da sonda é a forma da chave, e apenas uma sequência correspondente no DNA de destino permitirá que ela se ligue.

Outros fatores podem influenciar a força da ligação, mas o principal determinante da especificidade é a sequência da sonda.