Vários métodos são usados para estudar bactérias que não podem ser cultivadas em laboratório. Aqui estão alguns dos mais comuns:

1. Técnicas moleculares:

* Sequenciamento direto: O DNA pode ser extraído diretamente das amostras ambientais (solo, água, etc.) e sequenciado. Isso permite que os pesquisadores identifiquem as espécies presentes, mesmo que não possam ser cultivadas em um laboratório.
* PCR (reação em cadeia da polimerase): Sequências de DNA específicas podem ser amplificadas a partir de amostras ambientais usando PCR, permitindo a detecção e identificação de bactérias específicas.
* Metagenômica: Todo o material genético (DNA) de uma amostra ambiental é sequenciado, permitindo a identificação de todas as espécies bacterianas presentes, incluindo aquelas que não são cultivadas.
* Metatranscriptomics: Essa técnica analisa o RNA presente em uma amostra ambiental, fornecendo informações sobre os genes que estão sendo expressos ativamente pelas bactérias, oferecendo informações sobre suas funções e interações.

2. Técnicas microscópicas:

* Fluorescência in situ Hibridação (peixe): As sondas fluorescentes que se ligam a sequências específicas de DNA são usadas para visualizar bactérias em seu ambiente natural. Essa técnica permite que os pesquisadores identifiquem e quantifiquem bactérias específicas sem a necessidade de cultivá -las.
* Microscopia eletrônica (EM): O EM fornece imagens de alta resolução de bactérias, revelando sua morfologia e características estruturais. Embora o EM não possa identificar diretamente as espécies, pode ajudar na classificação de bactérias com base em sua aparência.

3. Ensaios funcionais:

* Rotulagem de isótopos: Os isótopos estáveis (como 13C ou 15N) são usados para rastrear o metabolismo das bactérias dentro de uma amostra ambiental. Isso permite que os pesquisadores estudem os papéis funcionais das bactérias no ecossistema, mesmo que não possam ser cultivadas.

4. Culturas de enriquecimento:

* Simulação de ambientes específicos: As condições ambientais são simuladas no laboratório para favorecer o crescimento de bactérias específicas. Esse método não envolve cultura completa, mas pode enriquecer a população de certas bactérias, facilitando seu estudo.

5. Técnicas de co-cultura:

* Crescendo com outros organismos: Algumas bactérias requerem a presença de outros organismos para crescer. Ao co-cultivar com espécies conhecidas, os pesquisadores às vezes podem cultivar com sucesso bactérias não cultiváveis.

É importante observar que esses métodos têm seus pontos fortes e limitações. Freqüentemente, uma combinação de abordagens é usada para obter uma compreensão mais abrangente das bactérias presentes em um ambiente específico.