Há um mal -entendido na questão. Não existem dois "domínios bacterianos". Os três domínios da vida são:

* Bactérias : Estes são procariontes (organismos unicelulares sem núcleo).
* Archaea: Estes também são procariontes, mas têm características bioquímicas únicas que as distinguem das bactérias.
* Eukarya: Estes são organismos com um núcleo e outras organelas ligadas à membrana, incluindo plantas, animais, fungos e protistas.

Portanto, "bactérias" é um domínio em si, não uma subcategoria dentro de outro domínio.