Os dois principais estágios da respiração ocorrem em diferentes locais dentro da célula:

* glicólise: Este primeiro estágio ocorre no citoplasma da célula.
* Ciclo de Krebs e Cadeia de Transporte de Eletrônicos: Esses estágios ocorrem nas mitocôndrias , especificamente dentro da matriz e na membrana interna das mitocôndrias, respectivamente.