O cientista mais associado a refutar a teoria da geração espontânea é Louis Pasteur .

Enquanto outros, como Francesco Redi, contribuíram para refutar a teoria, o famoso experimento de frasco de pescoço de cisne de Pasteur forneceu evidências fortes e conclusivas contra a geração espontânea. Ele demonstrou que o caldo estéril permaneceria estéril mesmo quando exposto ao ar, desde que o ar fosse filtrado para impedir a entrada de microorganismos. Isso provou que os organismos vivos só poderiam surgir de outros organismos vivos, não espontaneamente de matéria não-viva.