A grande unidade ribossômica (também conhecida como subunidade ribossômica 60S) possui vários locais de ligação importantes para a síntese protéica e são usados ​​pelo ribossomo durante o processo de tradução:

- Sítio de ligação do peptídeo (sítio P): O sítio P é responsável por conter a cadeia polipeptídica em crescimento. Durante a tradução, a molécula de RNA de transferência (tRNA) que transporta a cadeia polipeptídica em crescimento é ligada ao sítio P.

- Sítio aminoacil (A): O sítio A está localizado próximo ao sítio P e é onde a molécula de tRNA que chega carregando um novo aminoácido se liga. As moléculas de tRNA primeiro se ligam ao sítio A onde seu anticódon corresponde à sequência de três nucleotídeos do códon no mRNA.

- Saída (E) do site: O sítio E está posicionado próximo aos sítios A e P e fornece um ponto de saída para moléculas de tRNA que entregaram seus aminoácidos à cadeia polipeptídica em crescimento. Após a ligação dos fatores de liberação, liberando a cadeia polipeptídica, o tRNA desacilado sai através do sítio E.

- Centro de peptidil transferase: Localizado perto dos sítios P ​​e A, o centro da peptidil transferase é responsável por catalisar a formação de ligações peptídicas entre o aminoácido ligado ao tRNA no sítio A e o aminoácido no tRNA no sítio P.


Além desses locais de ligação ao tRNA, a grande subunidade ribossômica contém locais de ligação para vários fatores de tradução envolvidos na síntese protéica, como fatores de alongamento, fatores de liberação e GTPases, que desempenham papéis cruciais na facilitação de diferentes etapas do processo de tradução.