O tamanho das mitocôndrias pode variar dependendo do tipo de célula e do organismo, mas normalmente variam de 0,75 a 3 micrômetros de diâmetro. Em outras palavras, são muito pequenos, aproximadamente do tamanho de uma bactéria. As mitocôndrias são frequentemente descritas como em forma de feijão ou ovais, mas também podem ter outros formatos, como esferas ou bastonetes.