As células têm vários mecanismos para reunir e eliminar proteínas danificadas. Esses mecanismos são cruciais para manter a homeostase celular e prevenir o acúmulo de agregados proteicos tóxicos que podem levar a diversas doenças. Aqui estão dois processos principais envolvidos nesta limpeza celular:

1. Degradação Proteasomal:
O proteassoma é um grande complexo proteico encontrado em todas as células eucarióticas que funciona como um "triturador" celular de proteínas danificadas ou mal dobradas. O processo de degradação proteasomal envolve as seguintes etapas:

- Ubiquitinação: As proteínas danificadas são marcadas com pequenas moléculas de proteína chamadas ubiquitina. Este processo de marcação é realizado por enzimas conhecidas como ubiquitina ligases. Múltiplas moléculas de ubiquitina estão ligadas à proteína danificada, formando uma cadeia de poliubiquitina.
- Reconhecimento de proteassoma: As proteínas poliubiquitinadas são então reconhecidas e ligadas pelo proteassoma.
- Deubiquitinação: Antes que a proteína danificada possa ser degradada, os marcadores de ubiquitina são removidos por enzimas desubiquitinantes.
- Proteólise: Dentro do proteassoma, a proteína danificada é desdobrada e quebrada em pequenos fragmentos peptídicos. Esses peptídeos são então reciclados pela célula ou posteriormente degradados por outras proteases.

2. Autofagia:
A autofagia é um processo celular responsável pela degradação e reciclagem de vários componentes celulares, incluindo proteínas e organelas danificadas. Existem diferentes tipos de autofagia, mas a mais comum envolvida na remoção de proteínas danificadas é chamada de macroautofagia. As etapas da macroautofagia incluem:

- Formação de Autofagossomos: Uma estrutura de membrana dupla chamada autofagossomo é formada em torno das proteínas danificadas e de outros componentes citoplasmáticos.
- Fusão com Lisossomos: O autofagossomo então se funde com um lisossomo, uma organela ácida contendo enzimas hidrolíticas.
- Degradação: Dentro do lisossoma, as proteínas danificadas são expostas às enzimas lisossomais e decompostas nos seus blocos de construção básicos (aminoácidos). Esses blocos de construção são então reciclados pela célula.

Em resumo, a degradação proteasomal e a autofagia são dois processos essenciais que as células utilizam para reunir e eliminar proteínas danificadas. Ao remover proteínas e agregados proteicos danificados, as células podem manter a sua função adequada e proteger-se dos efeitos nocivos do mau enrolamento e agregação de proteínas.