Kumquat (Fortunella spp.), uma fruteira comum e árvore ornamental, é caracterizada por frutos pequenos, saborosos e brilhantes, semelhantes a laranja. As espécies cultivadas de Fortunella (F. margarita, F. crassifolia e F. japonica) são originárias da China e foram introduzidas na Europa pela primeira vez pelo botânico inglês Robert Fortune durante o período Daoguang da dinastia Qing da China. O kumquat selvagem de Hong Kong (F. hindsii) é amplamente distribuído no sul da China, e tem sido desenvolvido como um material modelo para a pesquisa da função de genes cítricos devido às suas características de nanismo, juvenilidade curta e monoembrionia.
No entanto, uma questão sobre esta espécie frutífera deixou perplexos estudiosos ocidentais (Walter T. Swingle, 1871–1952) e orientais (Tyôzaburô Tanaka, 1885–1976) no século passado:Qual é a relação filogenética entre as espécies cultivadas de Fortunella e a única existente espécies selvagens deste gênero, F. hindsii? As espécies cultivadas de Fortunella são domesticadas diretamente de F. hindsii ou sua origem está implicada com F. hindsii?

Para responder a essas perguntas, o Prof. Xiuxin Deng e sua equipe coletaram sistematicamente os acessos de Fortunella cultivados representativos e amostras selvagens de F. hindsii de toda a China nos últimos 10 anos. Usando SSR nuclear, SNP de cloroplasto e SNP genômico, a diversidade genética do gênero Fortunella foi amplamente avaliada e a história da evolução do gênero Fortunella foi traçada.

A análise genética mostrou claramente a filogenia independente do gênero Fortunella entre os táxons de citros, o que rejeitou a hipótese de origem da hibridização de Fortunella. Além disso, o gênero Fortunella exibiu uma estrutura genética óbvia e alta diferenciação genética nas duas principais populações de população cultivada de Fortunella e população selvagem de F. hindsii. A análise genômica mostrou que ambas as populações sofreram seleção direcional durante sua trajetória evolutiva. A dinâmica populacional assíncrona da população de Fortunella e da população selvagem de F. hindsii durante o período glacial Quaternário (QGP) foi anterior à atividade humana no sul da China, e os sinais de domesticação limitados dessas duas populações foram fracamente associados à diferença de fenótipos juntos, implicando que as espécies de Fortunella cultivadas não podem ser domesticadas diretamente de F. hindsii selvagem.

Com base nos resultados deste estudo e em um relatório filogeográfico anterior, Deng e sua equipe levantaram uma nova hipótese evolutiva para o gênero Fortunella. Após a diferenciação do gênero Citrus, o ancestral de Fortunella evoluiu para uma linhagem independente que foi amplamente distribuída no centro e no sul da China. Junto com a progressão do QGP, as populações do norte (o ancestral da Fortunella cultivada) e do sul (o ancestral do F. hindsii) foram gradualmente isoladas geneticamente umas das outras.

A população do norte foi confrontada com uma seleção natural mais precoce e mais severa, experimentando assim um declínio populacional mais precoce, eventualmente resultando em evolução adaptativa, como uma casca espessa com o enriquecimento de açúcar e metabólitos secundários para proteger as sementes do congelamento. A população do sul encontrou seleção natural moderada e tardia, mantendo assim o fenótipo primitivo. Junto com a migração dos humanos para o sul, alguns indivíduos da população do norte foram ocasionalmente selecionados e cultivados, e assim sobreviveram até agora, conhecidos como Nagami (F. margarita), Meiwa (F. crassifolia) e Marumi (F. japonês). A população do sul passou principalmente por seleção natural contínua e foi descoberta sucessivamente por antigos horticultores chineses e estudiosos ocidentais modernos, e foram nomeados como "Shan Jin'gan" em chinês e "kumquat de Hong Kong" em inglês, respectivamente.

Este estudo fornece informações úteis para a criação e conservação de Fortunella. A hipótese evolutiva também fornece uma nova perspectiva para pesquisas profundas sobre a filogenia deste gênero, que ainda exige evidências mais sólidas, como evidências fósseis relacionadas, e métodos mais avançados, como análise pan-genoma. Este estudo foi publicado na revista Frontiers of Agricultural Science and Engineering .