Foto do autor Zhipeng Li recebendo seu prêmio de faixa do prêmio GigaScience de um dos jurados, Dra. Kathy Belov, da Universidade de Sydney. Crédito:GigaScience
Com o fim do Halloween, hoje é tradicionalmente o dia em que as decorações de Natal são lançadas, portanto, é apropriado que um animal icônico associado à festa esteja ganhando um salto no espírito natalino ao se juntar à lista de espécies para ter seu genoma sequenciado. Publicado hoje na revista de acesso aberto GigaScience , é um artigo que descreve o sequenciamento e a análise do genoma da rena. Este trabalho, embora seja improvável que revele por que as renas do Papai Noel podem voar, fornece um ótimo recurso para obter uma maior compreensão dos processos de evolução, domesticação, criação animal, e adaptação a ambientes extremos.
A rena ( Rangifer tarandus ) é a única espécie totalmente domesticada no veado, ou Cervid, família. É também o único cervo com distribuição mundial:abrangendo a região boreal, tundra, subártico, regiões árticas e montanhosas do norte da Ásia, América do Norte e Europa. Ao contrário de todos os outros cervídeos, não é apenas o veado macho que cresce e solta chifres, mas também as mulheres. Do ponto de vista da pecuária, o leite de rena é muito mais rico em proteínas e tem menos lactose do que o leite de vaca. Este último aspecto torna a disponibilidade desse leite interessante, dado o alto percentual de pessoas com intolerância à lactose no mundo. Com esta variedade de recursos exclusivos, a disponibilidade de uma sequência do genoma da rena pode fornecer um trenó cheio de novas informações, e é um novo membro bem-vindo ao clube de elite de espécies domesticadas com genomas de referência, incluindo a vaca, ovelhas e cabras.
Este trabalho foi realizado por uma equipe de pesquisadores chineses da Academia Chinesa de Ciências Agrícolas de Changchun e da Universidade Politécnica do Noroeste de Xi'an. Os pesquisadores coletaram uma amostra de sangue de uma criança de dois anos, rena fêmea de um rebanho domesticado mantido por caçadores-pastores nômades Ewenki nas montanhas de Khingan, na China. Eles sequenciaram, montado, anotou o genoma e mostrou que era de alta qualidade. Comparação do genoma da rena com os genomas de espécies relacionadas e com os humanos, revelou que o tamanho do genoma da rena (2,6 GB ou 2,6 bilhões de pares de bases) é ligeiramente menor do que o dos humanos, vacas, e cabras, e aproximadamente do mesmo tamanho de ovelhas.
O primeiro autor do artigo, Zheping Li, professor associado do Instituto de Ciências Especiais de Animais e Plantas da Academia Chinesa de Ciências Agrárias, observou que a análise também identificou "335 genes específicos de renas que podem ajudar a compreender as características biológicas especiais das renas. Eles também podem ser muito úteis para compreender a evolução das renas, bem como de toda a família Cervid em futuras análises genômicas comparativas estudos entre renas e outros ruminantes. "
Com esse objetivo em mente, os pesquisadores também construíram uma árvore evolutiva usando o novo genoma e os genomas já disponíveis de membros da família dos bovinos. Eles encontraram aquela rena, gado, e cabras separadas de um ancestral comum há aproximadamente 29,6 milhões de anos. Isso foi durante a época do Oligoceno, onde uma das principais mudanças foi a expansão global das pastagens.
Este artigo foi um dos vencedores do concurso inaugural GigaScience competição e faixa de prêmio que é usada para promover novos, ponta, pesquisar. Os autores apresentaram seu trabalho em uma sessão especial na 12ª Conferência Internacional anual sobre Genômica da BGI em Shenzhen na sexta-feira, 27 de outubro. Como uma competição de ciência aberta, este e os outros artigos dos vencedores foram analisados de uma maneira totalmente aberta, onde o público poderia acompanhar todo o processo de publicação a partir de ter o rascunho do artigo disponível abertamente no servidor de pré-impressão da Biorxiv, o processo de revisão por pares feito ao vivo com revisões disponibilizadas antes da decisão de publicação no sistema de revisão de sobreposição do Academic Karma, seguido por decisões editoriais, revisões do manuscrito e publicação do artigo com todos os editores, autor, e a correspondência do revisor disponibilizada com o artigo publicado.