O microscópio óptico oferece diversas vantagens sobre o microscópio eletrônico em áreas específicas:

Preparação da amostra: A microscopia óptica requer uma preparação de amostra menos complexa em comparação com a microscopia eletrônica. As amostras para microscopia óptica podem muitas vezes ser observadas no seu estado natural ou com preparação mínima, como coloração ou montagem. Em contraste, as amostras para microscopia eletrônica muitas vezes precisam passar por um processamento extensivo, incluindo desidratação, incorporação, seccionamento e coloração, o que pode introduzir artefatos ou alterar a estrutura da amostra.

Imagens de células vivas: A microscopia óptica permite a observação de células e tecidos vivos em tempo real. Esta capacidade é particularmente útil para estudar processos dinâmicos dentro das células, tais como divisão celular, movimento de organelas e respostas celulares a vários estímulos. A microscopia eletrônica, por outro lado, normalmente requer amostras fixas e desidratadas, limitando sua aplicação a observações estáticas.

Microscopia de fluorescência: A microscopia óptica pode ser acoplada a técnicas de fluorescência para visualizar moléculas ou estruturas específicas dentro das células. Corantes ou sondas fluorescentes podem se ligar seletivamente a moléculas-alvo, permitindo aos pesquisadores investigar a localização, abundância e dinâmica dessas moléculas em células vivas. Essa capacidade é amplamente utilizada em biologia celular, biologia do desenvolvimento e imagens moleculares. A microscopia eletrônica não oferece o mesmo nível de especificidade molecular e depende de técnicas contrastantes para diferenciar os componentes celulares.

Imagem de campo amplo: A microscopia de luz permite iluminação de campo amplo, permitindo a observação de áreas maiores de uma amostra em comparação com a microscopia eletrônica. Isto permite a análise da arquitetura do tecido, da morfologia celular e das relações espaciais entre diferentes componentes celulares em um campo de visão maior.

Custo e acessibilidade: Os microscópios ópticos são geralmente mais baratos, acessíveis e fáceis de usar em comparação aos microscópios eletrônicos. Eles exigem equipamentos, treinamento e manutenção menos especializados, tornando-os mais amplamente utilizados em instituições de ensino e laboratórios de pesquisa básica.

Embora o microscópio eletrônico ofereça resolução superior e imagens detalhadas no nível ultraestrutural, o microscópio óptico oferece vantagens em termos de preparação de amostras, imagens de células vivas, análises baseadas em fluorescência, observações de campo amplo e acessibilidade de custos. Ambas as técnicas se complementam e desempenham papéis essenciais em diversos campos da pesquisa biológica.