Se a agricultura biológica é boa ou má para a vida selvagem depende do método de cultivo alternativo. Em comparação com a agricultura convencional, a agricultura biológica pode beneficiar enormemente a vida selvagem. Por exemplo, as práticas de agricultura biológica geralmente reduzem a utilização de pesticidas e fertilizantes sintéticos, que podem envenenar a vida selvagem e poluir os cursos de água. Além disso, a agricultura biológica envolve frequentemente rotação de culturas e culturas de cobertura, o que pode criar diversos habitats para a vida selvagem. Além disso, a agricultura biológica pode ajudar a preservar a qualidade do solo, reduzir a erosão e melhorar a qualidade da água, sendo todos benéficos para a vida selvagem.
No entanto, se a alternativa à agricultura biológica for uma prática agrícola mais sustentável ou amiga da vida selvagem, então a agricultura biológica pode não ser tão benéfica. Por exemplo, algumas práticas agroflorestais ou de permacultura podem proporcionar maiores benefícios à vida selvagem do que a agricultura biológica. Em última análise, as melhores práticas agrícolas para a vida selvagem dependerão do contexto e da localização específicos.