BO3-3 é um íon borato, que possui uma geometria molecular trigonal planar. O átomo de boro é hibridizado sp2, com três orbitais híbridos sp2 equivalentes formando ligações sigma com os três átomos de oxigênio. O orbital p restante no átomo de boro está vazio e perpendicular ao plano dos três átomos de oxigênio.