Os elétrons do fotossistema II vêm da divisão das moléculas de água. Este processo é realizado pelo complexo de evolução de oxigênio (OEC) do fotossistema II. O OEC é um aglomerado de quatro íons de manganês e um íon de cálcio que são mantidos juntos por uma estrutura proteica. Quando a energia luminosa é absorvida pelo fotossistema II, ela excita um elétron na molécula de clorofila do centro de reação. Este elétron é então transferido para um aceptor de elétrons e eventualmente atinge o OEC. O OEC usa a energia do elétron para dividir uma molécula de água em dois prótons e um átomo de oxigênio. Os prótons são bombeados para o lúmen do tilacóide, enquanto o átomo de oxigênio é liberado na atmosfera.