O doce, batata doce com amido de laranja são ingredientes saborosos e nutritivos para batatas fritas, caçarolas e tortas. Embora os humanos tenham cultivado batata-doce por milhares de anos, os cientistas ainda não sabem muito sobre a composição proteica desses tubérculos. Em ACS ' Journal of Proteome Research , pesquisadores analisaram o proteoma das folhas e raízes da batata-doce, e no processo, revelaram novos insights sobre o genoma da planta.

A batata doce ( Ipomoea batatas , Lam.) É um alimento básico em algumas partes do mundo, além de ser usado para ração animal e produtos industriais, como os biocombustíveis. A planta tem um genoma surpreendentemente complexo, codificando mais genes previstos do que o genoma humano. A batata-doce também tem uma composição química complexa, com baixo teor de proteína nas raízes (a parte que as pessoas comem) e muitos metabólitos secundários nas folhas, tornando difícil extrair quantidades suficientes de proteínas para análise. Sorina, George Popescu e colegas queriam ver se uma abordagem "proteogenômica" - analisando proteínas e dados genéticos juntos - poderia ajudá-los a obter uma melhor compreensão das composições das raízes e folhas da batata-doce.

A equipe extraiu proteínas de amostras de raízes e folhas usando dois métodos diferentes e as cortou em peptídeos, que eles analisaram com cromatografia líquida e espectrometria de massa. Os pesquisadores identificaram 3, 143 proteínas únicas de folhas de batata-doce e 2, 928 das raízes. Quando eles compararam os dados proteômicos com o genoma da batata-doce, eles identificaram algumas regiões na sequência do genoma publicada onde seus dados poderiam fornecer informações aprimoradas. Por exemplo, a análise previu 741 novas regiões codificadoras de proteínas que anteriormente não eram consideradas genes. O grupo diz que os resultados podem ser usados ​​para ajudar a caracterizar e biofortificar o tubérculo.