A molécula de motor associada a microtúbulos em cílios e flagelos é
dynein .
A dineína é uma proteína que atua como um motor molecular, convertendo energia química (da hidrólise ATP) em energia mecânica para gerar movimento. Nos cílios e flagelos, as moléculas de dineína se prendem a dupletos de microtúbulos e usam sua atividade motora para deslizar os microtúbulos além, causando o movimento de flexão característico dessas estruturas.