O mRNA pode ser encontrado em vários lugares dentro de uma célula:

* núcleo : É aqui que o mRNA é transcrito do DNA.
* nucleoplasma : O fluido dentro do núcleo, onde existe mRNA antes de se mover para o citoplasma.
* citoplasma: É aqui que o mRNA viaja após ser transcrito no núcleo. Em seguida, ele se associa a ribossomos.
* ribossomos: O mRNA se liga a ribossomos no citoplasma, onde serve como um modelo para síntese de proteínas (tradução).

Assim, enquanto o mRNA está associado principalmente ao citoplasma devido ao seu papel na síntese de proteínas, também gasta tempo no núcleo e nucleoplasma durante sua formação.