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  • Um cientista quer produzir artificialmente uma proteína produzida no fígado de sapos. A localização de todo o mRNA por fígado e cDNA. O que Shou?
    Aqui está um colapso das etapas que o cientista deve tomar, juntamente com as explicações das técnicas envolvidas:

    1. Isolar o mRNA para a proteína alvo:

    * Extração de RNA : O cientista precisará obter tecido hepático de sapos e extrair o RNA total. Isso envolve interromper as células e usar reagentes especializados para separar o RNA de outros componentes celulares.

    2. Crie uma biblioteca de cDNA:

    * Transcrição reversa: Usando o mRNA isolado, o cientista realizará transcrição reversa. Este é um processo em que uma enzima chamada transcriptase reversa converte o mRNA em DNA complementar (cDNA). Este cDNA servirá como modelo para clonagem.
    * Construção da biblioteca de cDNA: O cDNA é então inserido em vetores (geralmente plasmídeos) que podem se replicar nas bactérias. Esta coleção de vetores contendo diferentes fragmentos de cDNA é chamada de biblioteca de cDNA.

    3. Crie a biblioteca para o cDNA alvo:

    * Projeto da sonda: O cientista precisa de uma sonda para identificar o cDNA que codifica a proteína de sapo desejada. Esta sonda pode ser:
    * sonda de oligonucleotídeo: Uma sequência curta e sintética de DNA projetada com base na sequência conhecida da proteína alvo (se disponível).
    * sonda de anticorpos: Um anticorpo específico da proteína alvo pode ser usado para detectar o cDNA correspondente na biblioteca.
    * Triagem : A biblioteca de cDNA é rastreada com a sonda. Isso pode ser feito usando técnicas como:
    * hibridação de colônia: As bactérias que contêm a biblioteca de cDNA são plaqueadas em ágar. A sonda é rotulada e deixada se ligar às colônias. As colônias contendo o cDNA alvo hibridam com a sonda e podem ser identificadas.
    * Triagem PCR: A PCR (reação em cadeia da polimerase) pode ser usada para amplificar o cDNA alvo usando iniciadores projetados a partir da sequência conhecida.

    4. Sequência e verifique o cDNA alvo:

    * sequenciamento de Sanger: Uma vez isolado o cDNA alvo, ele precisa ser sequenciado para confirmar sua identidade e garantir que codifique a proteína correta.
    * Análise de Bioinformática: A sequência de cDNA pode ser comparada aos bancos de dados para encontrar sequências homólogas e confirmar sua identidade.

    5. Projetar e construir um vetor de expressão:

    * vetor de expressão: O cientista precisará de um vetor que possa ser usado para expressar a proteína alvo em um organismo hospedeiro adequado (por exemplo, bactérias, leveduras ou células de mamíferos). Este vetor de expressão incluirá:
    * Promotor: Uma sequência de DNA que impulsiona a expressão do gene alvo.
    * Gene -alvo (cDNA): O cDNA isolado que codifica a proteína sapo.
    * Local de ligação ao ribossomo (RBS): Uma sequência que ajuda os ribossomos a iniciar a síntese de proteínas.
    * Marcador de seleção: Um gene que permite a seleção de células que adotaram o vetor de expressão.

    6. Transforme o vetor de expressão em um organismo hospedeiro:

    * Transformação: O vetor de expressão que contém o cDNA alvo é introduzido em um organismo hospedeiro (por exemplo, células bacterianas).
    * Seleção: As células transformadas são selecionadas usando o marcador de seleção no vetor de expressão.

    7. Expresse e purifique a proteína alvo:

    * Expressão da proteína : As células hospedeiras são cultivadas em condições que promovem a expressão da proteína alvo.
    * Purificação da proteína: A proteína é extraída das células e purificada usando técnicas como cromatografia para separá -la de outros componentes celulares.

    8. Caracterização e análise:

    * Verificação: A proteína purificada é analisada para confirmar sua identidade, dobragem e atividade.
    * Estudos funcionais: A proteína pode ser usada para mais pesquisas, como investigar sua função, interações com outras moléculas ou seus possíveis usos terapêuticos.

    Considerações importantes:

    * dobramento da proteína : Garantir que a proteína se dobra corretamente no organismo hospedeiro seja crucial.
    * Modificações pós-traducionais: Algumas proteínas requerem modificações (por exemplo, glicosilação) após a tradução. O organismo hospedeiro pode não ser capaz de executar essas modificações, o que pode afetar a função da proteína.
    * Ética e segurança: Considerações éticas e protocolos de segurança adequados devem ser seguidos ao trabalhar com tecidos de sapo e organismos geneticamente modificados.

    Deixe -me saber se você quiser mais detalhes em qualquer etapa específica!
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