A principal diferença entre microorganismos e organismos está no tamanho e complexidade .

* organismos são qualquer coisa viva, incluindo plantas, animais, fungos, bactérias e até vírus. Eles são tipicamente visíveis a olho nu e tem estruturas e sistemas complexos que lhes permitem realizar processos de vida.

* Microorganismos são um subconjunto de organismos que são pequenos demais para serem vistos sem um microscópio . Eles incluem bactérias, archaea, fungos, protistas e alguns vírus. Esses organismos são unicelular ou multicelular mas tenha uma estrutura muito mais simples comparado a organismos maiores.

Aqui está uma tabela resumindo as principais diferenças:

| Recurso | Organismos | Microorganismos |
| --- | --- | --- |
| tamanho | Visível a olho nu | Muito pequeno para ser visto sem microscópio |
| complexidade | Estruturas e sistemas complexos | Estrutura simples, geralmente unicelular |
| Exemplos | Plantas, animais, fungos | Bactérias, archaea, fungos, protistas, vírus |

em suma: Todos os microorganismos são organismos, mas nem todos os organismos são microorganismos. Os microorganismos são simplesmente organismos que são microscopicamente pequenos.