O principal determinante principal na dobra do RNA é as interações de emparelhamento de bases entre nucleotídeos complementares.
Aqui está o porquê:
*
emparelhamento de bases: As moléculas de RNA, como o DNA, têm uma estrutura primária de uma cadeia linear de nucleotídeos. No entanto, diferentemente do DNA, o RNA é de fita única. Isso permite que o RNA se dobre em estruturas tridimensionais complexas. O fator mais importante que impulsiona esse dobramento é a formação de ligações de hidrogênio entre pares de bases complementares:adenina (a) com uracil (u) e guanina (g) com citosina (c).
*
Estrutura secundária: Esses pares de bases formam estruturas, protuberâncias e loops internos, que contribuem para a estrutura secundária geral da molécula de RNA.
*
Estrutura terciária: As estruturas secundárias então interagem entre si através de interações adicionais de pares de base, empilhamento e interações com o ambiente circundante, resultando em uma estrutura terciária complexa.
Enquanto o emparelhamento de bases é a força dominante, outros fatores também desempenham um papel:
* Interações hidrofóbicas: As bases não polares tendem a se agrupar, minimizando seu contato com a água.
* Interações eletrostáticas
: As cobranças na espinha dorsal do RNA e nas bases podem influenciar a dobra.
*
íons metálicos: Algumas moléculas de RNA requerem íons metálicos (como magnésio) para sua dobragem e função adequadas.
*
proteínas de ligação ao RNA: As proteínas podem interagir com o RNA e influenciar sua dobragem e função.
Em resumo, o emparelhamento de bases é o fator mais importante que impulsiona o dobramento do RNA, mas funciona em conjunto com outras interações para criar as estruturas tridimensionais intrincadas e funcionais características das moléculas de RNA.