Os grupos funcionais sempre encontrados nos aminoácidos são:

* grupo amino (-nh2) :É daí que vem o "amino" em aminoácido.
* grupo de ácido carboxílico (-COOH) :É isso que dá aos aminoácidos suas propriedades ácidas.

Esses dois grupos são o que definem um aminoácido. A cadeia lateral, ou grupo R, é o que varia entre diferentes aminoácidos, dando -lhes suas propriedades únicas.