Enquanto muitas pessoas imaginam o modelo composto da classe de laboratório quando pensam em microscópios, muitos tipos de microscópios estão realmente disponíveis. Esses dispositivos úteis são empregados por pesquisadores, técnicos médicos e estudantes diariamente; o tipo que eles selecionam depende de seus recursos e necessidades. Alguns microscópios fornecem maior resolução com menor ampliação e vice-versa, e variam em custos de dezenas a milhares de dólares.
Microscópio simples

O microscópio simples é geralmente considerado o primeiro microscópio. Foi criada no século XVII por Antony van Leeuwenhoek, que combinou uma lente convexa com um suporte para espécimes. Ampliando entre 200 e 300 vezes, era essencialmente uma lupa. Embora esse microscópio fosse simples, ainda era poderoso o suficiente para fornecer informações a van Leeuwenhoek sobre amostras biológicas, incluindo a diferença de formas entre os glóbulos vermelhos. Hoje, microscópios simples não são usados com freqüência porque a introdução de uma segunda lente levou ao microscópio composto mais poderoso.
Microscópio Composto

Com duas lentes, o microscópio composto oferece melhor ampliação do que um simples microscópio; a segunda lente amplia a imagem da primeira. Microscópios compostos são microscópios de campo claro, o que significa que a amostra é iluminada por baixo e podem ser binoculares ou monoculares. Esses dispositivos fornecem uma ampliação de 1.000 vezes, considerada alta, embora a resolução seja baixa. Essa alta ampliação, no entanto, permite que os usuários observem de perto objetos pequenos demais para serem vistos a olho nu, incluindo células individuais. As amostras são geralmente pequenas e têm algum grau de transparência. Como os microscópios compostos são relativamente baratos e úteis, eles são usados em todos os lugares, desde laboratórios de pesquisa até salas de aula de biologia do ensino médio.
Microscópio estéreo

O microscópio estéreo, também chamado de microscópio de dissecação, fornece ampliação de até 300 vezes . Esses microscópios binoculares são usados para observar objetos opacos ou grandes demais para serem visualizados com um microscópio composto, uma vez que não requerem preparação de lâmina. Embora sua ampliação seja relativamente baixa, eles ainda são úteis. Eles fornecem uma visualização 3D em close das texturas de superfície dos objetos e permitem que o operador manipule o objeto durante a visualização. Os microscópios estéreo são usados em aplicações de ciências biológicas e médicas, bem como na indústria eletrônica, como por aqueles que fabricam placas de circuito ou relógios.
Microscópio Confocal

Ao contrário dos microscópios estéreo e compostos, que usam luz regular para formação de imagem, o microscópio confocal usa uma luz laser para digitalizar amostras que foram tingidas. Essas amostras são preparadas em lâminas e inseridas; depois, com o auxílio de um espelho dicromático, o dispositivo produz uma imagem ampliada na tela do computador. Os operadores também podem criar imagens 3D, montando várias digitalizações. Como o microscópio composto, esses microscópios oferecem um alto grau de ampliação, mas sua resolução é muito melhor. Eles são comumente usados em biologia celular e em aplicações médicas.
Microscópio eletrônico de varredura (SEM)

O microscópio eletrônico de varredura, ou SEM, usa elétrons em vez de luz para a formação da imagem. As amostras são digitalizadas em condições de vácuo ou quase-vácuo, portanto, elas devem ser especialmente preparadas, primeiro submetidas à desidratação e depois revestidas com uma fina camada de material condutor, como o ouro. Depois que o item é preparado e colocado na câmara, o SEM produz uma imagem 3D em preto e branco na tela do computador. Oferecendo amplo controle sobre a quantidade de ampliação, os SEMs são usados por pesquisadores das ciências físicas, médicas e biológicas para examinar uma variedade de amostras, de insetos a ossos.
Microscópio Eletrônico de Transmissão (TEM)

Ao microscópio eletrônico de varredura, o microscópio eletrônico de transmissão (TEM) usa elétrons na criação de uma imagem ampliada e as amostras são digitalizadas no vácuo, para que sejam especialmente preparadas. Ao contrário do SEM, no entanto, o TEM usa uma preparação de slides para obter uma visualização 2-D de amostras, por isso é mais adequado para a exibição de objetos com algum grau de transparência. Um TEM oferece um alto grau de ampliação e resolução, tornando-o útil nas ciências físicas e biológicas, metalurgia, nanotecnologia e análises forenses.