p É o "estranho caso do Dr. Jekyll e Mr. Hyde" em um berçário. p Existem principalmente espécies benignas no solo, gênero de bactéria associado a plantas conhecido como Rhodococcus , mas algumas espécies podem ser patogênicas. Uma equipe de pesquisadores da Oregon State University usou o sequenciamento do genoma para identificar espécies de Rhodococcus aquela transição entre benéfico e patogênico - estimulando o crescimento em algumas plantas no primeiro caso, enquanto deforma os tecidos no último.

p Os resultados foram publicados hoje na revista. eLife .

p A chave para Rhodococcus a transição entre bactérias "boas" e "más" é possibilitada por moléculas de DNA conhecidas como plasmídeos, disse Jeff Chang, um genomicista microbiano no College of Agricultural Sciences da OSU e líder do estudo. Um plasmídeo é uma molécula de DNA mantida separadamente do cromossomo da bactéria.

p "A facilidade com que ocorre a transição é bastante incomum, e apresenta um desafio difícil para os berçários, "ele disse." Cepas benéficas de Rhodococcus causar o crescimento da planta que pode ser mal interpretado como sintomas de doenças. Rastreamos como os membros benéficos e patogênicos da Rhodococcus estão mudando de planta em planta e de viveiro em viveiro. Agora podemos informar a indústria de viveiros para implementar práticas para limitar sua disseminação. "

p Rhodococcus infecta principalmente plantas perenes herbáceas, incluindo a margarida Shasta, speedwell e crisântemo. Existem menos hospedeiros lenhosos que são comumente infectados, mas eles incluem arbusto de borboleta e espirea falsa.

p A transição evolutiva pelo movimento de plasmídeos tem o potencial de fazer novas linhagens de patogênicos Rhodococcus em creches e outros ambientes, Disse Chang.

p Os resultados do estudo podem ter um impacto na indústria de viveiros e estufas de Oregon de US $ 900 milhões. As plantas deformadas não são esteticamente agradáveis ​​e as plantas doentes não podem ser enviadas para fora do estado, então a única alternativa é destruir as plantas infectadas.

p Para ajudar os berçários, OSU desenvolveu ferramentas moleculares para trabalhar com kits disponíveis comercialmente que permitem ao usuário discriminar de forma rápida e eficaz entre as cepas benéficas e patogênicas de Rhodococcus . OSU entrou com um pedido de patente para as ferramentas moleculares, desenvolvido por Skylar Fuller, que obteve um mestrado em biologia molecular e celular na OSU na primavera passada.

p A observação de que os plasmídeos estão se movendo entre as cepas de Rhodococcus foi feito por Alexandra Weisberg, um pós-doutorado no laboratório de Chang. Weisberg usou ferramentas genômicas para estudar padrões de plasmídeo.

p "Esses plasmídeos podem ser transferidos de uma bactéria para outra, o que torna o rastreamento da doença difícil, "Weisberg disse." Rastrear os plasmídeos separadamente do cromossomo foi a chave para entender como essas transições se relacionam entre si. "

p Por mais de uma década, Melodie Putnam, diagnosticador-chefe da Clínica de Plantas da OSU, tem trabalhado com viveiros de Oregon para identificar corretamente as bactérias que estão causando defeitos de crescimento incomuns em plantas infectadas.

p "Os sintomas de Rhodococcus muitas vezes não são fáceis de reconhecer, "Putnam disse." Até este estudo, nós não sabíamos como Rhodococcus comportado em creches. Não sabíamos se havia uma população residente que continuava se infectando ou se os berçários estavam recebendo de outros berçários. Agora temos uma imagem mais clara dos diferentes cenários. "

p Em 2014, Putnam foi contatado por um pesquisador em outra universidade que encontrou sintomas estranhos em árvores de pistache. Eles eram baixos e cheios, tinha hastes nodosas e não enxertava corretamente. O pesquisador presumiu que patogênicos Rhodococcus foi o culpado, mas Putnam encontrou apenas as cepas não patogênicas de bactérias nas 100 ou mais amostras de plantas sintomáticas submetidas à Plant Clinic.

p Putnam e seu grupo de pesquisa trabalharam junto com Chang e seu grupo liderado por Elizabeth Savory, em seguida, um pesquisador de pós-doutorado no laboratório de Chang, e Fuller. Os dois grupos estudaram algumas das bactérias associadas ao pistache e as testaram em várias espécies de plantas. Os estudos levaram a conclusões semelhantes:as cepas cultivadas de pistache pareciam não ser patogênicas.

p "Essa foi a nossa primeira indicação de que essas cepas que eles estavam cultivando do pistache eram o que encontramos nas plantas em geral que têm um efeito benéfico, "disse Savory, agora gerente de fitossanidade do Departamento de Agricultura de Oregon. "É possível que cepas benéficas de Rhodococcus causar mudanças no crescimento da planta que podem ser erroneamente interpretadas como sintomas de doenças. "