p Dr. Jacob Malone, do John Innes Center. Crédito:John Innes Center
p As complexas redes de sinalização que as bactérias usam para se adaptar a seus ambientes tornaram-se mais claras após novas pesquisas. p Os pesquisadores do John Innes Center usaram um estudo da bactéria Pseudomonas fluorescens, promotora do crescimento de plantas, para desenvolver um método de análise avançado que, eles esperam, aumentará nossa capacidade de entender doenças humanas e vegetais.
p Até recentemente, as investigações sobre a sinalização bacteriana tendem a olhar para diferentes aspectos da regulação gênica isoladamente. Com base nessas abordagens individuais, a equipe de John Innes usou uma variedade de laboratórios, técnicas computacionais e matemáticas para integrar dados obtidos a partir de vários experimentos microbiológicos diferentes.
p Esta abordagem permitiu-lhes construir um 'mapa de sinalização' abrangente para a proteína bacteriana Hfq, que controla a virulência e as respostas ao estresse em muitas espécies importantes do ponto de vista clínico e agrícola.
p Dr. Jacob Malone, O líder do projeto associado ao trabalho explicou:"Nossa técnica nos permite seguir cada gene e proteína em uma célula bacteriana, e diga como isso muda e em que nível essa mudança ocorre, em resposta a uma determinada entrada de sinal.
p "Estamos usando os mesmos conjuntos de dados de estudos anteriores, mas desenvolvemos uma maneira de integrar os dados usando matemática e programação. Se você considerar os elementos individuais de um filme:a fotografia, a trilha sonora e o roteiro; combinando-os, você obtém um filme inteiro - algo maior do que a soma das partes. Este é o mesmo princípio, apenas com genética. "
p As descobertas da equipe, publicado em
Fronteiras em Microbiologia (Analisando o cenário regulatório complexo de Hfq - um integrativo, Abordagem Multi-Omics, Grenga, L. et al. 2017) prometem mudar a forma como investigamos as redes de sinalização bacteriana, e aumentará nossa compreensão de como as bactérias interagem com seus ambientes e mediam infecções.
p "As pessoas analisaram dados em mais de um nível antes, mas não nesta profundidade ", disse o Dr. Malone." Em última análise, gostaríamos que as pessoas considerassem abordar os dados dessa maneira rotineiramente, "